Ruminococcus

Ruminococcus est un genre de bactéries anaérobiques gram positif de la famille des Oscillospiraceae.

Ruminococcus

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Embranchement	Firmicutes
Classe	Clostridia
Ordre	Eubacteriales
Famille	Oscillospiraceae

Genre

Ruminococcus
Sijpesteijn, 1948

Il caractérise un entérotype de type 3[1]^,[2]^,[3].

Certaines bactéries de ce genre sont connues pour être pro-inflammatoire (ex : Ruminococcus lactaris), et la surabondance de Ruminococcus est corrélée avec

une maladie auto-immune, le lupus érythémateux disséminé[4]. L'espèce Ruminococcus gnavus se retrouve dans le système intestinal de 90% des individus[5]. Il est moins abondant chez les patients atteints de la maladie de Parkinson[6] ;
un risque accru de croissance rapide d'un cancer de la prostate et de résistance de ce cancer à l'hormonothérapie, car certaines bactéries du genre Ruminococcus produisent des androgènes à partir de précurseurs apportés par le bol alimentaire, et ces androgènes passent aisément dans le sang en jouant alors un rôle de perturbateur endocrinien vis-à-vis de l'organisme et des médicaments anti-androgène[7].
un risque accru de Syndrome de l'intestin irritable[8].

Liste des espèces

Selon GBIF (11 juillet 2021)[9] :

Ruminococcus albus Hungate, 1957
Ruminococcus bromii Moore et al., 1972
Ruminococcus callidus Holdeman & Moore, 1974
Ruminococcus champanellensis Chassard et al., 2012
Ruminococcus faecis Kim et al., 2011
Ruminococcus flavefaciens A
Ruminococcus flavefaciens B
Ruminococcus flavefaciens C
Ruminococcus flavefaciens D
Ruminococcus flavefaciens E
Ruminococcus flavefaciens F
Ruminococcus flavefaciens G
Ruminococcus flavefaciens H
Ruminococcus flavefaciens I
Ruminococcus flavefaciens J
Ruminococcus flavefaciens K
Ruminococcus flavefaciens L
Ruminococcus flavefaciens M
Ruminococcus flavefaciens N
Ruminococcus flavefaciens O
Ruminococcus flavefaciens P
Ruminococcus flavefaciens Q
Ruminococcus flavefaciens R
Ruminococcus flavefaciens S
Ruminococcus flavefaciens T
Ruminococcus gauvreauii Domingo et al., 2008
Ruminococcus gnavus Moore et al., 1976
Ruminococcus lactaris Moore et al., 1976
Ruminococcus torques Holdeman & Moore, 1974

Publication originale

(en) A. Kaars Sijpesteijn, « Cellulose-decomposing bacteria from the rumen of cattle », thèse, Université de Leyde,‎ 1948 (ISSN 1572-9699, DOI 10.1007/BF02062631, lire en ligne, consulté le 11 juillet 2021)

Notes et références

(en) M. Arumugam, J. Raes […] P. Bork, « Enterotypes of the human gut microbiome », Nature, vol. 473,‎ 2011, p. 174–180 (résumé)
(en) Brandon Keim, « Gut-Bacteria Mapping Finds Three Global Varieties », Wired.com,‎ 04.20.2011 (lire en ligne)
(en) Andy Coghlan, « Each human has one of only three gut ecosystems », New Scientist.com,‎ 20 avril 2011 (lire en ligne)
https://www.biocodexmicrobiotainstitute.com/publications/ruminococcus-gnavus-le-grand-mechant-loup-du-lupus
« Des bactéries friandes de sucres bénéfiques pour notre flore intestinale », sur Futura (consulté le 11 novembre 2023).
Hill-Burns, EM; Debelius, JW; Morton, JT; Wissemann, WT; Lewis, MR; Wallen, ZD; Peddada, SD; Factor, SA; Molho, E; Zabetian, CP; Knight, R; Payami, H (May 2017).Parkinson's disease and Parkinson's disease medications have distinct signatures of the gut microbiome. Movement Disorders
(en) Nicolò Pernigoni, Elena Zagato, Arianna Calcinotto et Martina Troiani, « Commensal bacteria promote endocrine resistance in prostate cancer through androgen biosynthesis », Science, vol. 374, n^o 6564,‎ 8 octobre 2021, p. 216–224 (ISSN 0036-8075 et 1095-9203, DOI 10.1126/science.abf8403, lire en ligne, consulté le 30 octobre 2021)
(en) Ulla Hynönen, Pia Rasinkangas, Reetta Satokari et Lars Paulin, « Isolation and whole genome sequencing of a Ruminococcus-like bacterium, associated with irritable bowel syndrome », Anaerobe, vol. 39,‎ 1^er juin 2016, p. 60–67 (ISSN 1075-9964, DOI 10.1016/j.anaerobe.2016.03.001, lire en ligne, consulté le 30 octobre 2021)
GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulté le 11 juillet 2021

Liens externes

(en) Référence BioLib : Ruminococcus Sijpesteijn, McGowan & Sneath, 1948 (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence Catalogue of Life : Ruminococcus Sijpesteijn, 1948 (consulté le 11 juillet 2021)
(fr + en) Référence EOL : Ruminococcus (consulté le 11 juillet 2021)
(fr + en) Référence GBIF : Ruminococcus Sijpesteijn, 1948 (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence IRMNG : Ruminococcus Sijpesteijn, 1948 (Approved Lists, 1980) (consulté le 11 juillet 2021)
(fr + en) Référence ITIS : Ruminococcus Sijpesteijn, 1948 (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence NCBI : Ruminococcus Sijpesteijn 1948 (taxons inclus) (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence OEPP : Ruminococcus (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence Taxonomicon : Ruminococcus Sijpesteijn 1948 (Approved Lists 1980) (consulté le 11 juillet 2021)
(en) Référence WoRMS : Ruminococcus Sijpesteijn, 1948 (+ liste espèces) (consulté le 11 juillet 2021)

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[1] (en) M. Arumugam, J. Raes […] P. Bork, « Enterotypes of the human gut microbiome », Nature, vol. 473,‎ 2011, p. 174–180 (résumé)

[2] (en) Brandon Keim, « Gut-Bacteria Mapping Finds Three Global Varieties », Wired.com,‎ 04.20.2011 (lire en ligne)

[3] (en) Andy Coghlan, « Each human has one of only three gut ecosystems », New Scientist.com,‎ 20 avril 2011 (lire en ligne)

[4] ttps://www.biocodexmicrobiotainstitute.com/publications/ruminococcus-gnavus-le-grand-mechant-loup-du-lupus

[5] « Des bactéries friandes de sucres bénéfiques pour notre flore intestinale », sur Futura (consulté le 11 novembre 2023).

[6] Hill-Burns, EM; Debelius, JW; Morton, JT; Wissemann, WT; Lewis, MR; Wallen, ZD; Peddada, SD; Factor, SA; Molho, E; Zabetian, CP; Knight, R; Payami, H (May 2017).Parkinson's disease and Parkinson's disease medications have distinct signatures of the gut microbiome. Movement Disorders

[ScienceBacteriologie2021-7] (en) Nicolò Pernigoni, Elena Zagato, Arianna Calcinotto et Martina Troiani, « Commensal bacteria promote endocrine resistance in prostate cancer through androgen biosynthesis », Science, vol. 374, n^o 6564,‎ 8 octobre 2021, p. 216–224 (ISSN 0036-8075 et 1095-9203, DOI 10.1126/science.abf8403, lire en ligne, consulté le 30 octobre 2021)

[8] (en) Ulla Hynönen, Pia Rasinkangas, Reetta Satokari et Lars Paulin, « Isolation and whole genome sequencing of a Ruminococcus-like bacterium, associated with irritable bowel syndrome », Anaerobe, vol. 39,‎ 1^er juin 2016, p. 60–67 (ISSN 1075-9964, DOI 10.1016/j.anaerobe.2016.03.001, lire en ligne, consulté le 30 octobre 2021)

[GBIF11_juillet_2021-9] GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulté le 11 juillet 2021